神经外科前身为1960年由市中心迁至闵行地区的上海市第五人民医院大外科下属的脑外科组。2003年独立设科,收治各类颅脑外伤及合并伤、颅脑肿瘤、脑血管病变等。2005年5月11日正式挂牌成立为上海市华山医院神经外科集团医院市五分院，各项业务全面开展。分院院长由知名的华山医院李士其教授担任，主持分院各项工作。2007年评为闵行区特色科室。
李士其教授擅长垂体瘤的微创手术，具有创伤小，疗效好、安全性高，恢复快的特点，在神经外科界颇具知名度。众多上海本地及周边省市的患者慕名前来就治，垂体瘤手术也成为我分院的一大特色。目前，我神经外科主要承担了闵行和周边地区的神经外科疾病的救治工作，开展了经鼻蝶窦垂体瘤切除术、脑膜瘤切除术、胶质瘤切除术、椎管内肿瘤切除术、小脑海绵状血管瘤切除术、听神经瘤切除术、桥小脑角囊肿切除术、动脉瘤夹闭术、小脑动静脉畸形切除术等多项手术；并与介入科配合，开展DSA全脑血管造影术；与闵行区肿瘤医院合作，便于恶性脑瘤患者术后能及时进行放疗，巩固疗效。
科室技术力量雄厚，现有神经外科医生9名，主任医师、教授2名，副教授医师3名，主治医师2名，住院医师2名。床位41张，设有重症病房、VIP病房，配置有进口专用手术床及手术头架、手术开颅器械、双极电凝、神经外科手术显微镜、显微手术器械、进口呼吸机、心肺监护仪、电动降温毯、微量注射泵、微量输液泵等先进设备。