临床微生物室配备BacT ALERT 3D血培养仪、Vitek32细菌鉴定仪，开展的检验项目有：1、各类标本（呼吸道、尿液、脑脊液、胸、腹水、胆汁、脓液、眼耳鼻喉拭子、生殖系统、粪便、标本）常见细菌的培养、鉴定及药敏试验：引进国外先进检测系统(Vitek32细菌鉴定仪)； 2、血液及骨髓培养；3、真菌培养； 4、淋病细菌学检；5、支原体感染的实验室诊断；6、结核杆菌涂片及结核杆菌培养；7、医源性感染的监测。长期以来坚持定期向临床反馈我室常见细菌的耐药变迁情况；工作中积极加强与临床的联系，尽力满足临床需求；强化质量意识，不断提高检测质量；加强服务意识，不断改善服务态度。
在认真开展室内质量控制活动的同时，积极参加各类室间质量控制活动。
临床微生物室还承担蚌埠医学院医学检验专业本科生的实验诊断课堂教学及实验带教的教学工作。
临床微生物室属于复旦大学附属上海市第五人民医院检验科。拥有先进的仪器设备，检测项目比较齐全。
工作重点：以病人为中心，为临床感染患者提供高质量的病原学诊断治疗服务是我们的宗旨。
采用国际先进的血培养仪BacT ALERT 3D和 配套的血培养瓶
引进国外先进检测系统(Vitek32细菌鉴定仪)